Doordat deze larven verborgen zitten in het merg zijn ze niet te raken met gewasbeschermingsmiddelen en is een bestrijding onmogelijk. De volwassen vlinders kunnen wel worden bestreden. Dit kan door een bespuiting met Decis uit te voeren of door het vangen van de vlinders met feromoonvallen. Het bessenglasvlinder feromoon heeft de naam Synanthedon tipuliformis. Dit feromoon zit in een plastic dopje dat in een Deltaval geplaatst kan worden. Dit feromoon trekt de mannelijke vlinders aan, waarna deze op de lijmbodem van de val vastgeplakt blijven zitten. Een kleine aantasting kan zo redelijk bestreden worden.
Lopen de vangsten in de feromoonvallen spectaculair op, meer dan 20 vlinders per val, dan is het een optie om dezelfde dag een bespuiting met Decis uit te voeren. Uiteraard heeft een bespuiting met Decis ook effect op alle aanwezigen nuttigen in de aanplant, maar door deze strategie meerdere jaren consequent toe te passen wordt de aantasting door de bessenglasvlinder flink gereduceerd. Hang tenminste 4 vallen per hectare uit, bij voorkeur in mei.